山洞是位于农场北侧的一处重要地点，玩家需要累计赚取25000金后才会触发相关剧情。当德米特里厄斯来访并提出研究请求时，玩家需在果蝠（生成水果）和蘑菇（每天采集）之间做出选择，该选择不可逆且直接影响后续资源获取方法。山洞的入口位置固定，但内部功能会根据玩家选择产生差异，这是游戏前期资源规划的决定因素节点其中一个。

关于山洞的具体功能，选择蘑菇洞会生成6个蘑菇盒子，每天可收获一次但无法保留至次日，适合需要稳定获取蘑菇资源的玩家，尤其是用于社区中心任务或制作生活药水。而选择果蝠洞则也许不定期生成多种水果，虽然产量不固定但可长期储存，对完成工匠收集包或送礼有较大帮助。两种选择各有优劣，需结合玩家当前进步阶段和长期目标决定。

山洞的解开时刻通常为游戏第一年秋季前后，具体取决于玩家的资金积累速度。1.6版本更新后，蘑菇的生长机制调整为两天一获，而水果的生成概率未受影响。若玩家已选择蘑菇洞但后期需要水果，可通过温室种植果树弥补，但需额外投入时刻和资金成本。

对于进阶玩家而言，游戏还存在另壹个名为精通山洞的独特区域，位于煤矿森林，需要五项技能全部达到10级才能解开。该山洞内有五根代表不同精通能力的柱子，每达成一项精通即可获取对应能力提高，属于游戏后期的核心挑战内容。和农场山洞不同，精通山洞更侧重技能检验而非资源产出。

游戏中的矿洞体系和山洞属于不同机制，位于地图东北部木匠商店附近的桥对岸，共120层且每10层为独立主题区域。而头骨山洞作为沙漠区域的进阶矿洞，需先修复巴士并获取头骨钥匙才能进入，其层数无限且无电梯保存功能，是获取铱矿石的主要场所。这些洞穴体系和农场山洞在功能定位和寻觅方法上存在本质不同差异。